De Scheper is aangesloten bij Stichting Proceon.
Proceon is een stichting voor Protestants Christelijk Onderwijs in het Gooi en omgeving waar 20 scholen voor primair onderwijs bij aangesloten zijn. De stichting bestaat sinds 1 september 2006 en staat voor identiteit en kwaliteit, in de meest brede zin van het woord. Het bestuur is verantwoordelijk voor alles wat op de scholen gebeurt. Het uitvoerende werk van het bestuur wordt gedaan door de algemeen directeur, daarbij ondersteund door 2 stafmedewerkers.